Dentro de la auditoría informática destacan los siguientes tipos (entre otros):
Auditoría de la gestión: Referido a la contratación de bienes y servicios, documentación de los programas, etc.
Auditoría legal del Reglamento de Protección de Datos: Cumplimiento legal de las medidas de seguridad exigidas por el Reglamento de desarrollo de la ley organica y de protección de datos
Auditoría de los datos: Clasificación de los datos, estudio de las aplicaciones y análisis de los flujogramas.
Auditoría de las bases de datos: Controles de acceso, de actualización, de integridad y calidad de los datos.
Auditoría de la seguridad: Referidos a datos e información verificando disponibilidad, integridad, confidencialidad, autenticación y no repudio.
Auditoría de la seguridad física: Referido a la ubicación de la organización, evitando ubicaciones de riesgo, y en algunos casos no revelando la situación física de esta. También está referida a las protecciones externas (arcos de seguridad, CCTV, vigilantes, etc.) y protecciones del entorno.
Auditoría de la seguridad lógica: Comprende los métodos de autenticación de los sistemas de información.
Auditoría de las comunicaciones.
Auditoría de la seguridad en producción: Frente a errores, accidentes y fraudes.
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